13 июня главный редактор «Новой газеты» Дмитрий Муратов опубликовал открытое письмо главе Следственного комитета Александру Бастрыкину, в котором обвинил его в угрозах шеф-редактору издания Сергею Соколову. По словам Муратова, Бастрыкин был недоволен статьей, в которой Соколов, по сути, обвинил правоохранительные органы в «укрывательстве» виновных в массовом убийстве в станице Кущевская. Муратов описал, как Бастрыкин публично отчитал Соколова на совещании в Нальчике, а на обратном пути отвез журналиста в подмосковный лес и угрожал его жизни. В письме Муратов потребовал гарантий безопасности для Соколова и других сотрудников «Новой».
Опубликованное Муратовым письмо имело большой резонанс: в тот же день журналисты и общественные деятели вышли на одиночные пикеты в поддержку Сергея Соколова к зданию Следственного комитета, несколько человек были задержаны. На следующий день Александр Бастрыкин принес извинения Муратову и Соколову за эмоциональный срыв. «Нашему сотруднику Соколову больше ничего не угрожает. Конфликт исчерпан», — заявил Муратов, чем вызвал раскол в журналистской среде. Одни возмущались, что вышли на акции в поддержку «Новой газеты», а та удовлетворилась простыми извинениями, другие говорили, что гарантии безопасности сотрудников, которые получил Муратов, важнее любых претензий медиасообщества.
Больше всех ситуация почему-то возмутила журналистов радиостанции «Эхо Москвы». Вот, например, что заявила ведущая радиостанции Ксения Ларина.
Матвей Ганапольский с «Эха» тоже не смог сдержать эмоций.
И Маша Гессен, тогда — главный редактор ИД «Вокруг света».
И блогер Рустем Адагамов.
Журналист и правозащитник Александр Подрабинек вступился за Муратова, но отказался принимать извинения Бастрыкина.
Валерий Ширяев из «Новой газеты» объяснил позицию Муратова, отметив, что никто в издании не просил коллег-журналистов о помощи.
Еще одно объяснение от сотрудников «Новой» — от репортера Елены Костюченко.
Выступил с заявлением даже совладелец «Новой газеты» Александр Лебедев.
На «Эхе Москвы» нашлись, однако, и журналисты, которые приняли позицию Муратова — например Ольга Бычкова.
Дмитрий Ольшанский, главный редактор «Русской жизни», как всегда, съязвил в адрес наивной интеллигенции.